园艺研究所主攻柑桔、蓝莓、杨梅、花木和中药材的选育种、高效栽培技术及成果转化推广应用。组建果树选育和花木与中药材选育科研主岗团队2支，现有科研人员16人，其中正高职称2人，副高3人，博士1人，入选省“151”、市“551”、市领军（D类）人才5人。拥有国家、省级农业科技园区，温州市园艺植物育种重点实验室和省级柑桔、中药材区域试验站。建成训研创一体化智能大棚13800平方米、园艺育种及快繁实验室700平方米、山地高效栽培果园和果树资源圃105亩。

近三年，研究所主持完成中央财政支持林技推广项目、浙江省十三五农业新品种选育蓝莓樱桃子课题和省基础公益项目金线莲林下仿野生种植等6项，主持承担省、市厅级课题和科技特派员项目30多项，获国家梁希林业科学技术三等奖、浙江省科技进步三等奖、省科技兴林二、三等奖等7项，发表核心期刊论文22篇，SCI收录5篇，授权发明专利5件，实用新型专利22件。成功选育国内第一个审定金线莲新品种“健君1号”，育成糯米山药“文糯1号”、木槿“玉盘龙珠”、白及“浙及1号”、甘薯“温薯1号”和大果型蓝莓等新品种7个，累计培育并推广蓝莓、金线莲等良种种苗90多万株，示范推广新技术3.5多万亩，开展技术培训120多期，为农增收2.68亿元，加快培育新质生产力，助力乡村振兴和共同富裕。